BRCA1

Type 1 brystkreft mottakelighet protein

Plassering av BRCA1-genet på kromosom 17.
tilgjengelige strukturer
PDB

Finn ortologer: PDBe , RCSB

 Liste over PDB-koder1JM7 , 1JNX , 1N5O , 1OQA , 1T15 , 1T29 , 1T2U , 1T2V , 1Y98 , 2ING , 3COJ , 3K0H, 3K0K , 3K15 , 3K16 , 3PXA , 3PXB , 3PXC , 4IGPXE , 4IGPXE , 4IGPXE , 4IGPXE , 4IGPXE
Identifikatorer
symboler BRCA1 (HGNC: 1100) BRCAI; BRCC1; BROVCA1; IRIS; PNCA4; PPP1R53; PSCP; RNF53

Eksterne identifikatorer
plassering Kr. 17 q21
              genontologi
molekylær funksjon DNA- reparasjon, tumorundertrykker , transkripsjonsregulator , sentrosomdynamikk
Referanser: AmiGO / QuickGO
mRNA-ekspresjonsmønster
Mer informasjon
Orthologer
Arter
Menneskelig Mus
Entrez
672 12189
ensemble
Se HS Se MM
UniProt
P38398 P48754
RefSeq
(mRNA)
NM_007294 NM_009764
RefSeq
(protein) NCBI
NP_009225 NP_033894
Plassering (UCSC)
Cr. 17:
41,2 – 41,32 Mb
Cr. 11:
101,49 – 101,55 Mb
PubMed (søk)
[1]


[to]

BRCA1 ( brystkreft 1 ) er et humant tumorsuppressorgen som regulerer cellesyklusen og forhindrer ukontrollert spredning. BRCA1 -proteinet , et produkt av dette genet, er en del av DNA- skadedeteksjons- og reparasjonssystemet . BRCA1 -genet er lokalisert på denlange (q) armen til kromosom 17 , i posisjon 21, fra basepar 38.449.843 til basepar 38.530.933. Ulike mutasjoner av dette genet er involvert i noen typer kreft , spesielt brystkreft . Hos kvinner som bærer mutasjoner i BRCA1-genet, er den kumulative risikoen opptil 70 år estimert mellom 51 og 95 % for brystkreft og mellom 22 og 66 % for eggstokkreft . [ 1 ]

Discovery

Det første beviset for eksistensen av dette genet ble innhentet av King-laboratoriet ved University of California i 1990. [ 2 ] Fire år senere, etter et internasjonalt kappløp for å finne det, [ 3 ] ble genet klonet av University of California Utah, 'National Institute of Environmental Health Sciences' (NIEHS) og 'Myriad Genetics'. [ 4 ]

Mutasjoner og kreftrisiko

Noen varianter av BRCA1 -genet fører til at den berørte personen har høy risiko for å utvikle brystkreft gjennom hele livet. Forskere har identifisert mer enn 600 mutasjoner i BRCA1-genet, hvorav mange er assosiert med økt risiko for kreft . Disse mutasjonene kan bestå av endringer i ett eller et lite antall DNA- basepar , som kan identifiseres ved PCR og DNA- sekvensering .

I noen tilfeller involverer mutasjoner omorganisering av store DNA-segmenter. Denne typen mutasjon, noen ganger kalt store omorganiseringer, kan bestå av sletting eller duplisering av en eller flere eksoner av genet. Klassiske metoder for mutasjonsdeteksjon (sekvensering) er ikke i stand til å avsløre denne typen mutasjoner. [ 5 ] Andre metoder er foreslått: Q-PCR, [ 6 ] Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA), [ 7 ] og Quantitative Multiplex PCR of Shorts Fluorescents Fragments (QMPSF). [ 8 ] Nye metoder har nylig blitt foreslått: heterodupleksanalyse (HDA) i kapillærelektroforese eller også komparativ genomisk hybridisering (array CGH). [ 9 ]

Engasjementet av BRCA1 i utviklingen av brystkreft er bevist i flere studier. Noen resultater tyder på at hypermetylering kan betraktes som en mekanisme for å inaktivere BRCA1-ekspresjon, som er rapportert i noen krefttilfeller. [ 10 ]

Vanligvis produserer et mutert BRCA1-gen et protein som ikke fungerer som det skal fordi det er unormalt kort. Forskerne mener at det defekte BRCA1-proteinet ikke er i stand til å hjelpe til med å korrigere mutasjoner som oppstår i andre gener. Disse defektene akkumuleres og kan tillate celler å vokse og dele seg ukontrollert og danne en svulst . I tillegg til brystkreft , øker mutasjoner i BRCA1-genet også risikoen for kreft i eggstokkene , egglederne og prostata. På den annen side har precancerøse lesjoner ( dysplasi ) i egglederne vært knyttet til BRCA1-genmutasjoner.

Mutasjonssignaturer assosiert med BRCA1 og BRCA2

Mutasjonssignaturer for kreft er mutasjonsprosesser i DNA til celler som følger et karakteristisk og fast mønster. Av 560 analyserte brystkreftformer hadde 90 kimlinje- eller somatiske inaktiverende mutasjoner i BRCA1 eller BRCA2, eller viste metylering av BRCA1-promotoren. Tap av kromosom 17 eller 13 ble sett i 80 av de 90 tilfellene. Disse viste mange signatur 3 base substitusjonsmutasjoner og signatur 8 doble nukleotidsubstitusjoner.Disse to signaturene er således assosiert med fravær av BRCA1 og BRCA2.

Kreft med mutasjoner i BRCA1, men ikke BRCA2, viser et stort antall små tandemduplikasjoner av omorganiseringssignatur 3. Kreft med mutasjoner i BRCA1 eller BRCA2 viser et betydelig antall slettinger av omorganiseringssignatur 5. [ 11 ]

Patenter og kontroverser

I 1994, gjennom University of Utah, ' National Institute of Environmental Health Sciences ' og ' Myriads Genetics ', patenterte de i USA isolasjonen av BRCA1-genet og mutasjonene knyttet til en større disposisjon for kreft, så vel som slike. som metoder for å diagnostisere sjansene for å få brystkreft. [ 12 ] På denne måten ble BRCA1-genet det første patenterte genet, etterfulgt av BRCA2 av 'Myriad Genetics' i 1995. [ 13 ]

På denne måten overtok 'Myriad Genetics' patentet til disse genene, og tilbød studiene deres til høye kostnader og forhindret parallelle studier for å bekrefte deres gyldighet. [ 14 ]

I juni 2013 kunngjorde USAs høyesterett at et DNA-segment er et naturlig produkt, som ikke under noen omstendigheter kan patenteres. [ 15 ] Denne avgjørelsen ugyldiggjorde patentet på BRCA1 og BRCA2. Imidlertid er en juridisk prosess i denne saken fortsatt åpen i den føderale domstolen i Australia. [ 16 ]

Referanser

  1. Effektiviteten av forebyggingsprotokoller hos kvinner som bærer BRCA1/2-mutasjoner . Cochrane Plus Library, 2013 utgave 3 ISSN 1745-9990
  2. ^ 'Hall JM, Lee MK, Newman B, Morrow JE, Anderson LA, Huey B, King MC (desember 1990). "Kobling av tidlig oppstått familiær brystkreft til kromosom 17q21". Science 250 (4988): 1684–9.' http://www.sciencemag.org/content/250/4988/1684
  3. http://scienceblog.cancerresearchuk.org/2012/02/28/high-impact-science-tracking-down-the-brca-genes-part-1/
  4. 'Miki Y, Swensen J, Shattuck-Eidens D, Futreal PA, Harshman K, Tavtigian S, Liu Q, Cochran C, Bennett LM, Ding W, et al. (oktober 1994). "En sterk kandidat for mottakelighetsgenet BRCA1 for bryst- og eggstokkreft". Science 266 (5182): 66–71.' http://www.sciencemag.org/content/266/5182/66
  5. ^ Mazoyer S. (2005). "Genomiske omorganiseringer i BRCA1- og BRCA2-genene". Hum Mutat. 25 (5):415-22. PMID  15832305 . doi : 10.1002/humu.20169 . 
  6. Barrois M. et al (2004). Sanntids PCR-basert gendoseanalyse for å oppdage BRCA1-omorganiseringer i bryst-ovariekreftfamilier. Clin Genet. 65 (2): 131-6. PMID  14984472 . doi : 10.1111/j.0009-9163.2004.00200.x . 
  7. Hogervorst FB. et al (2003). "Store genomiske slettinger og duplikasjoner i BRCA1-genet identifisert ved en ny kvantitativ metode". Cancer Res. 63 (7): 1449-53. PMID  12670888 . 
  8. Casilli F. et al (2002). "Rask påvisning av nye BRCA1-omorganiseringer i høyrisiko bryst-ovariekreftfamilier ved bruk av multipleks PCR av korte fluorescerende fragmenter". Hum Mutat. 20 (3): 218-26. PMID  12203994 . doi : 10.1002/humu.10108 . 
  9. Rouleau E. et al (2007). "Høyoppløselig oligonukleotid array-CGH brukt til påvisning og karakterisering av store omorganiseringer i det arvelige brystkreftgenet BRCA1". Clin Genet. 72 (3): 199-207. PMID  17718857 . doi : 10.1111/j.1399-0004.2007.00849.x . 
  10. Tapia T, Smalley SV, Kohen P, Muñoz A, Solis LM, Corvalan A, Faundez P, Devoto L, Camus M, Alvarez M, CARVALLO P. (2008). "Å fremme hypermetylering av BRCA1 korrelerer med fravær av uttrykk i arvelige brystkreftsvulster." Epigenetikk. 3 (3): 157-163. PMID  18567944 . Teksten "10.1186/bcr1858" ignorert ( hjelp ) 
  11. Nik-Zainal, Serena; Davis, Helen; Staaf, Johan; Ramakrishna, Manasa; Glodzik, Dominik; Zou, Xueqing; Martincorena, Inigo; Alexandrov, Ludmil B. et al. . "Landskap av somatiske mutasjoner i 560 brystkrefthelgenomsekvenser" . Nature 534 (7605): 47-54. PMC  4910866 . PMID  27135926 . doi : 10.1038/nature17676 . 
  12. 'Skolnick HS, Goldgar DE, Miki Y, Swenson J, Kamb A, Harshman KD, Shattuck-Eidens DM, Tavtigian SV, Wiseman RW, Futreal PA, "7Q-linked breast and ovarian cancer susceptibility gen"' http:// worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?CC=US&NR=5747282&KC
  13. 'Tavtigian SV, Kamb A, Simard J, Couch F, Rommens JM, Weber BL, "Chromosome 13-linked breast cancer susceptibility gene"' http://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?CC=US&NR=5837492&KC
  14. http://www.nytimes.com/2009/05/13/health/13patent.html
  15. http://www.nytimes.com/2013/06/14/us/supreme-court-rules-human-genes-may-not-be-patented.html?_r=0
  16. http://www.smh.com.au/national/health/landmark-patent-ruling-over-breast-cancer-gene-brca1-20130215-2egsq.html

Eksterne lenker