Entrez

Entrez

Fyr	online database og biologisk database
Nettsted	www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery

Entrez ( Global Query Cross-Database Search System ) gir tilgang til databasen National Center for Biotechnology Information (NCBI) . NCBI er en del av National Library of Medicine (NLM), samt en avdeling av National Institutes of Health (NIH) i USAs regjering .

Databaser

Entrez søker i følgende databaser:

PubMed - sitater og sammendrag fra biomedisinsk litteratur, inkludert Medline - tidsskriftartikler (hovedsakelig medisinske), ofte inkludert sammendrag. Lenker til PubMed Central og andre fulltekstressurser er gitt for artikler fra 1990-tallet.
PubMed Central – Gratis tidsskriftartikler i fulltekst
Nettstedsøk: NCBI-nettsteder og FTP-nettsteder
Bøker: bøker på nett
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
Nukleotid : Sekvensdatabase ( GenBank )
Protein : Sekvensdatabase
Genom – Helgenomsekvenser og kartlegging
Struktur : tredimensjonale makromolekylære strukturer
Taksonomi : organismer i GenBank-taksonomien
dbSNP : enkeltnukleotidpolymorfisme
Gen : [ 1 ] informasjon sentrert om genet
HomoloGene – eukaryote homologigrupper
PubChem- forbindelse: Unike kjemiske strukturer av små molekyler
PubChem-stoff: Registreringer av deponerte kjemiske stoffer
Genomprosjekt : informasjon om genomprosjektet
UniGene - klynger av genmålrettede transkripsjonssekvenser
DCC – Conserved Protein Domains Database
PopSet – populasjonsstudiedatasett ( epidemiologi )
GEO- profiler: molekylært uttrykk og overflodsprofiler
GEO-datasett – Eksperimentelle GEO-datasett
Stream Read Archive - High Performance Stream Data
Kreftkromosomer : Cytogenetiske databaser
PubChem BioAssay – Bioaktivitetstesting av kjemiske stoffer
Probe : sekvensspesifikke reagenser
NLM-katalog : NLM-bibliografiske data for over 1,2 millioner tidsskrifter, bøker, media, programvare, elektroniske ressurser og annet materiale som ligger på LocatorPlus (oppdateres hver ukedag)

Få tilgang til

I tillegg til å bruke søkemotorskjemaer for å søke etter data i Entrez, tilbyr NCBI Entrez Programming Utilities [ 2 ] (eUtils) for mer direkte tilgang til søkeresultater. eUtils er tilgjengelig ved å legge ut spesiallagde URL-er til NCBI-serveren, og analysere XML-svaret. Det var også et SOAP -grensesnitt til eUtils som ble avsluttet i juli 2015. [ 3 ]

Referanser

Eksterne lenker

Offesiell nettside