Fag T4

Enterobacteriaceae T4 fag
Klassifisering av virus
Domene :	Duplodnaviria
Klynge:	I ( dobbeltstrenget DNA-virus )
klasse :	Caudoviricetes
Bestilling :	Caudovirale midler
familie :	Myoviridae
kjønn :	T4-lignende virus
Arter :	Enterobacteriaceae fag T4

Fag T4 eller bakteriofag T4 er et type I DNA-virus som infiserer Escherichia coli - bakterier . Den er omtrent 200 nm i størrelse . Fag T4 tilhører T-gruppen, som også inkluderer enterobakteriofagene T2 og T6. Fag T4 har kun en lytisk livssyklus , og ikke en lysogen .

DNAet er dobbelttrådet og lineært, det måler 169 kb og kan kode for opptil 289 typer proteiner .

For å bevare sitt DNA ved å unngå virkningen av nukleasene til vertscellen, inneholder den nitrogenholdige baser som er forskjellige fra de vanlige, som cytidin og hydroksymetylcytidin . På denne måten kan viruset bruke sine egne nukleaser til å ødelegge celle-DNA til verten, bakterien E. coli .

Strukturen er kompleks. Den består av en kapsomere (med DNA inni) eller hode, festet til en krage og en hale. Ved sin siste ende har halen en basalplate, der parasittene befinner seg (nedre del av platen) og som halens fibre er festet til, noe som tillater fagens forening med bakterien. En slags 'whisker' vises på kragen, miljøsensorer som forhindrer faginfeksjon under ugunstige forhold ved å regulere tilbaketrekkingen av halefibrene. Alle strukturer er proteiner.

Phage T4 har noen unike funksjoner som:

• Høy DNA-kopieringshastighet med bare én feil hver 300. kopi.
• Spesielle reparasjonsmekanismer.
• Terminalredundanser som kan rekombinere og danne konkatemerer. DNAet til modne virioner er resultatet av å kutte konkatemerene i enhetene som danner det, virusgenomet.

Replikativ syklus

Dens livssyklus (fra den kommer inn i bakterien til den er ødelagt) varer i omtrent 30 minutter (ved 37° C ) og består av:

• Adsorpsjon og penetrering (starter umiddelbart).
• Umiddelbart tidlige gener blir transkribert (starter umiddelbart).

• Forsinkede tidlige gener blir transkribert (starter etter 2 minutter).
• Nedbrytning av E. coli -genomet av virale enzymer.
• Transkripsjon av sene gener (starter etter 5 minutter).
• DNA-replikasjon (starter etter 10 minutter).

• Slutt på transkripsjon av tidlige gener (etter 12 minutter).
• Virusdannelse ( kapsiden settes sammen, halen og til slutt halefibrene festes til den (starter etter 12 minutter).

Transkripsjonskontroll

Det utføres av blant annet følgende proteiner:

• Alt og Mod: utfør ADP-ribosyleringen av Arg265 til alfa-underenheten til RNA-polymerase.

• MotA: binder seg til DNA for å aktivere transkripsjon av forsinkede tidlige gener.

• AsiaA: Blokkerer transkripsjon av umiddelbare tidlige gener og nesten alle cellulære gener.

• gp55: alternativ σ-faktor. Positiv transkripsjonskontroll.

• gp33: brodannende protein mellom RNA-polymerase og gp55. Positiv transkripsjonskontroll.

Introner

Fag T4 har introner, som er en svært sjelden egenskap blant virus. De er tilstede i td- , nrdB- og sunY-genene . De er selvspleisende introner og RNA fungerer som et enzym som katalyserer transesterifiseringsreaksjoner og overføring av fosfodiesteriske bindinger.

Intronene som er tilstede i td- og sunY- genene er mobile og kan katalysere deres overføring til et annet DNA-molekyl.

Andre T-fager

• T1
• T2
• T3
• T5
• T6
• T7

Referanser

1. ↑ Padilla-Sanchez, Victor (2021). "Strukturell modell av bakteriofag T4" . WikiJournal of Science 4 (1): 5. doi : 10.15347/WJS/2021.005 .