Fosfodiesterase

fosfodiesterase
tilgjengelige strukturer
PDB	enzymstrukturerRCSB PDB , PDBe , PDBsum
Identifikatorer
Eksterne identifikatorer	EnzymdatabaserIntEnz : IntEnz oppføring BRENDA : BRENDA oppføring ExPASy : NiceZime view KEGG : KEEG oppføring PRIAM : PRIAM profil ExplorEnz : ExplorEnz oppføring MetaCyc : Metabolic pathway
EC-nummer	3.1.4
Proteinstruktur/funksjon
protein type	hydrolase
Funksjoner	Enzym
Orthologer
Arter	Menneskelig Mus
Plassering (UCSC)	n/a n/a
PubMed (søk)	[1]
PMC (søk)	[to]
v du og

Fosfodiesteraser (PDE) eller nukleaser er hydrolase- enzymer ( EC 3.1.4 ) som katalyserer nedbryting av fosfodiesterbindinger , [ 1 ] slik som de etablert i nukleinsyrer mellom pentosen til et nukleotid og fosfatgruppen til andre. Dens virkning regulerer konsentrasjonen i cellene av syklisk AMP og syklisk GMP ( sykliske nukleotidfosfodiesteraser ). 5 isoenzymer er beskrevet . For tiden er det medisiner som brukes som fosfodiesterasehemmere ( koffein , aminofyllin , sildenafil , etc.).

De er klassifisert etter typen nukleinsyre og typen binding de hydrolyserer .

Typer

• Ribonukleaser . De er RNA -spesifikke , og det er derfor de også kalles RNAser eller RNaser.
• Deoksyribonukleaser . De er spesifikke for DNA , og det er derfor de også kalles DNase eller DNase.
• Eksonukleaser . De spalter det siste nukleotidet fra 5'- eller 3'-enden av et polynukleotid . De kan fullstendig bryte ned en lineær nukleinsyre.
• Endonukleaser . De kutter fosfodiesterbindingene som ligger inne i polynukleotidene. Disse enzymene krever ikke en fri ende, så de kan kutte sirkulære nukleinsyrer. Noen endonukleaser, slik som DNase I og DNase II , er ikke veldig spesifikke med hensyn til sekvensen av nukleotider de hydrolyserer.
  • Restriksjon Endonukleaser . De er endonukleaser som gjenkjenner og kutter svært spesifikke nukleotidsekvenser (palindromiske sekvenser i et dobbelttrådet DNA), denne typen enzym er mye brukt i rekombinante DNA-teknikker .
• Meganukleaser : Disse er svært spesifikke. De modifiserer proteiner og er i stand til å fikse mutasjonen som skader den og forårsaker en viss sykdom . Vi bør ikke forveksle dem med de såkalte "sinkfingrene" nukleaser som kutter genetisk materiale .

Meganukleaser

Denne typen nuklease brukes for tiden i molekylær terapi for å behandle sykdommer. Sinkfingernukleaser er utformet slik at "sinkfinger"-domenene gjenkjenner spesifikke sekvenser nær mutasjonen, slik at nukleasedomenet kutter dobbelttrådet DNA. Når vi har fordøyd sekvensen som bar mutasjonen, kan vi introdusere en vill kopi av det berørte genet i cellen, slik at cellen kan bruke den som en mal for å rekonstruere sekvensen, men uten noen mutasjon. Disse nukleasene har en rekke fordeler og ulemper:

Fordeler

• Med denne strategien integrerer vi ingen sekvens i genomet slik at vi unngår mulige mutasjoner.
• En reparasjon av den muterte sekvensen til genet utføres.
• Høy effektivitet.
• Det er ikke nødvendig å opprettholde uttrykket av et eksogent gen på lang sikt.

Ulemper

• Levedyktig i ex vivo-terapier.
• Høy immunogen kraft.
• Studier av dens uskadelighet bør utføres.

Referanser

1. ↑ Devlin, TM 2004. Biochemistry , 4. utgave. Jeg snudde, Barcelona. ISBN 84-291-7208-4