Ribonukleinsyre

Ribonukleinsyre ( RNA ) er en nukleinsyre som består av en kjede av ribonukleotider . [ 1 ] Det finnes i både prokaryote og eukaryote celler , og er det eneste genetiske materialet til visse virus ( RNA-virusene ).

RNA kan defineres som et molekyl som består av en enkelt kjede av ribonukleotider, som hver består av ribose , et fosfat og en av de fire nitrogenholdige basene ( adenin , guanin , cytosin og uracil ). Cellulært RNA er lineært og enkelttrådet (enkeltrådet), men i noen virusgenomer er det dobbelttrådet. [ 2 ]

I cellulære organismer utfører den flere funksjoner. Det er molekylet som styrer mellomstadiene av proteinsyntesen ; DNA kan ikke handle alene, og bruker RNA til å overføre denne vitale informasjonen under proteinsyntese (produksjon av proteiner som cellen trenger for dens aktiviteter og utvikling). [ 3 ] Flere typer RNA regulerer genuttrykk , mens andre har katalytisk aktivitet . RNA er dermed mye mer allsidig enn DNA.

Oppdagelse og historie

Nukleinsyrer ble oppdaget i 1867 av Friedrich Miescher , som kalte dem nuklein , siden han isolerte dem fra cellekjernen . [ 4 ] Senere ble det funnet at prokaryote celler, som mangler en kjerne, også inneholdt nukleinsyrer. Rollen til RNA i proteinsyntesen ble mistenkt i 1939. [ 5 ] Severo Ochoa vant Nobelprisen i medisin i 1959 etter å ha oppdaget hvordan RNA ble syntetisert. [ 6 ]

I 1965 fant Robert W. Holley sekvensen av 77 nukleotider av et gjæroverførings -RNA , [ 7 ] som han ble tildelt Nobelprisen i medisin med i 1968. I 1967 verifiserte Carl Woese de katalytiske egenskapene til noen RNA-er og foreslo at tidlig livsformer brukte RNA som en bærer av genetisk informasjon så vel som en katalysator for deres metabolske reaksjoner ( RNA-verdenshypotese ). [ 8 ] [ 9 ] I 1976 bestemte Walter Fiers og hans samarbeidspartnere den komplette RNA-sekvensen til genomet til et RNA-virus ( bakteriofag MS2 ). [ 10 ]

I 1990 ble det oppdaget i Petunia at introduserte gener kan dempe lignende gener fra samme plante, noe som fører til oppdagelsen av RNA-interferens . [ 11 ] [ 12 ] Omtrent samtidig ble mikro-RNA , små 22-nukleotidmolekyler som spilte en viss rolle i utviklingen av Caenorhabditis elegans , funnet . [ 13 ] Oppdagelsen av RNA-er som regulerer genuttrykk har tillatt utviklingen av medisiner laget av RNA-er, for eksempel små forstyrrende RNA -er som gjør gener til taushet. [ 14 ]

I år 2016 er det praktisk talt bevist at RNA-molekyler var den første formen for liv som egentlig bodde på planeten Jorden ( ARN World Hypothesis ).

RNA biokjemi

I likhet med DNA består RNA av en kjede av repeterende monomerer kalt nukleotider. Nukleotider er koblet etter hverandre med negativt ladede fosfodiesterbindinger .

Hvert nukleotid består av tre komponenter:

  1. Et fem -karbon monosakkarid ( pentose ) kalt β-D-ribofuranose .
  2. en fosfatgruppe
  3. En nitrogenholdig base , som kan være
    1. Adenin (A)
    2. Cytosin (C)
    3. Guanin (G)
    4. Uracil (U)
Sammenligning mellom RNA og DNA
RNA DNA
pentose Ribose deoksyribose
puriner Adenin og Guanin Adenin og Guanin
Pyrimidiner cytosin og uracil Cytosin og tymin

Ribosekarboner er nummerert 1' til 5' i retning med klokken. Den nitrogenholdige basen er festet til 1'-karbonet; fosfatgruppen binder seg til 5'-karbonet og 3'-karbonet i ribosen til neste nukleotid. Toppen har en negativ ladning ved fysiologisk pH , noe som gir RNA en polyanionisk karakter . Purinbaser ( adenin og guanin) kan danne hydrogenbindinger med pyrimidinbaser (uracil og cytosin) i henhold til skjemaet C=G og A=U. [ 15 ] I tillegg er andre interaksjoner mulige, for eksempel basestacking [ 16 ] eller tetraloops med G=A-paringer. [ 15 ] Mange RNA inneholder, i tillegg til de vanlige nukleotidene, modifiserte nukleotider, som oppstår ved transformasjon av de typiske nukleotidene; de er karakteristiske for overførings-RNA -er (tRNA-er) og ribosomale RNA -er (rRNA-er); metylerte nukleotider finnes også i eukaryot messenger-RNA . [ 17 ]

Dobbel parring

Hydrogenbindingsinteraksjonen beskrevet av Watson og Crick [ 18 ] danner basepar mellom en purin og en pyrimidin. Dette mønsteret er kjent som en Watson og Crick-paring . I den parrer adenin seg med uracil (tymin, i DNA) og cytosin med guanin. Imidlertid forekommer mange andre former for parring i RNA, hvorav den mest allestedsnærværende er slingringsparringen (også svaieparring eller nølende parring ) for GU-paret. Dette ble først foreslått av Crick for å forklare kodon-antikodon-paring i tRNA og har blitt bekreftet i nesten alle RNA-klasser i alle tre fylogenetiske domener. [ 19 ]

Struktur

Primærstruktur

Det refererer til den lineære sekvensen av nukleotider i RNA-molekylet. Følgende strukturelle nivåer (sekundær, tertiær struktur) er en konsekvens av primærstrukturen. Videre kan sekvensen i seg selv være funksjonell informasjon; dette kan oversettes til å syntetisere proteiner (i tilfelle av mRNA) eller fungere som en gjenkjenningsregion, katalytisk region, blant andre.

Primær struktur av tRNA Phe

Sekundær struktur

RNA folder som et resultat av tilstedeværelsen av korte regioner med intramolekylær baseparing, det vil si basepar dannet av mer eller mindre fjerne komplementære sekvenser innenfor samme tråd. Sekundær struktur refererer altså til baseparingsforhold: "Begrepet 'sekundær struktur' betegner ethvert plant mønster av baseparingskontakter. Det er et topologisk konsept og må ikke forveksles med en slags todimensjonal struktur. [ 20 ] Den sekundære strukturen kan beskrives fra strukturelle motiver som vanligvis klassifiseres som følger:

Vanlige strukturelle elementer [ 21 ]
Propell

(stamme, stabel)

Baseparret region.
Løkke

(syklus, sløyfe)

Område inkludert i en helix der basene ikke er sammenkoblet.
hårnålsløkke

(stamme og løkke, hårnålsløkke)

Struktur der nærliggende områder av komplementære baser parer seg, atskilt med en uparet region som lar sekvensen foldes for å danne en helix.
intern sløyfe

(intern sløyfe)

Struktur der det er uparrede områder på begge sider av tråden. Det kan være symmetrisk eller asymmetrisk.
Sjef

(utbulning)

Struktur der det er et uparet område på bare den ene siden av tråden.
flere sløyfer

(spiralformet kryss)

Region der flere helikser møtes.
pseudoknot Sløyfevariasjon hvor kun en del av løkken er paret. Den enkleste pseudoknoten består av et fritt område av RNA paret med en løkke.

Tertiær struktur

Tertiær struktur er resultatet av interaksjoner i rommet mellom atomene som utgjør molekylet. Noen slike interaksjoner inkluderer basestabling og andre baseparinger enn de som er foreslått av Watson og Crick, for eksempel Hoogsteen-paringer, trippelparinger og riboseglidelåser.

Propell A

I motsetning til DNA, er RNA-molekyler vanligvis enkelttrådede og danner ikke lange doble helikser; i baseparrede områder danner de imidlertid helikser som et tertiært strukturelt motiv. Et viktig strukturelt trekk ved RNA som skiller det fra DNA er tilstedeværelsen av en 2'- hydroksylgruppe på ribosen, som får RNA-dobbeltspiraler til å anta en A -konformasjon i stedet for den mer vanlige B [ 22 ] Denne A-helixen har et veldig dypt og smalt hovedspor og et bredt og grunt mindre spor. [ 23 ] En annen konsekvens av tilstedeværelsen av hydroksylen er at fosfodiesterbindingene til RNA i områdene der dobbelthelixen ikke dannes er mer utsatt for kjemisk hydrolyse enn de til DNA; RNA-fosfodiesterbindinger hydrolyseres raskt i alkalisk løsning , mens DNA-bindinger er stabile. [ 24 ] Halveringstiden til RNA-molekyler er mye kortere enn for DNA, noen få minutter i enkelte bakterielle RNA-er eller noen dager i humane tRNA-er. [ 17 ]

Biosyntese

RNA-biosyntese katalyseres normalt av enzymet RNA-polymerase ved å bruke en DNA-streng som mal, en prosess kjent som transkripsjon . Derfor kommer alle cellulære RNA-er fra kopier av gener som er tilstede i DNA .

Transkripsjon begynner med enzymets gjenkjennelse av en promoter , en karakteristisk sekvens av nukleotider i DNA som ligger før segmentet som skal transkriberes; DNA- dobbelthelixen åpnes av helikaseaktiviteten til selve enzymet. RNA-polymerase fortsetter deretter langs DNA-tråden i 3' → 5'-retningen, og syntetiserer et komplementært RNA-molekyl; denne prosessen er kjent som forlengelse, og veksten av RNA-molekylet skjer i 5' → 3'-retningen. Nukleotidsekvensen til DNA bestemmer også hvor RNA-syntesen slutter, fordi den har karakteristiske sekvenser som RNA-polymerase gjenkjenner som termineringssignaler. [ 25 ]

Etter transkripsjon blir de fleste RNA-er modifisert av enzymer . For eksempel har nylig transkribert eukaryotisk pre-budbringer-RNA et modifisert guanin-nukleotid ( 7-Methylguanosin ) tilsatt i 5'-enden via en trifosfatbro som danner en unik 5'→ 5'-binding, også kjent som "cap" eller "cap" og en lang sekvens av adenin-nukleotider ved 3'-enden (poly-A-hale); deretter fjernes intronene (ikke-kodende segmenter) i en prosess kjent som "spleising" .

I virus er det også flere RNA-avhengige RNA-polymeraser som bruker RNA som mal for syntese av nye RNA-molekyler. For eksempel bruker forskjellige RNA-virus, som poliovirus , disse typer enzymer for å replikere genomet deres . [ 26 ]​ [ 27 ]

RNA-klasser

Messenger RNA (mRNA) er typen RNA som bærer informasjon fra DNA til ribosomene , stedet for proteinsyntese. Nukleotidsekvensen til mRNA bestemmer aminosyresekvensen til proteinet . [ 28 ] Derfor kalles mRNA for kodende RNA.

Imidlertid koder mange RNA ikke for proteiner, og kalles ikke-kodende RNA ; de stammer fra egne gener ( RNA-gener ), eller blir intronene avvist under spleiseprosessen. Ikke-kodende RNA-er inkluderer overførings-RNA (tRNA) og ribosomalt RNA (rRNA), som er kritiske elementer i translasjonsprosessen , og ulike typer regulatoriske RNA-er. [ 29 ]

Visse ikke-kodende RNA, kalt ribozymer , er i stand til å katalysere kjemiske reaksjoner som å kutte og sammenføye andre RNA-molekyler, [ 30 ] eller danne peptidbindinger mellom aminosyrer på ribosomet under proteinsyntese . [ 31 ]

RNA involvert i proteinsyntese

Messenger RNA

Messenger RNA (mRNA) er den som bærer informasjonen om aminosyresekvensen til proteinet fra DNA , der det er innskrevet, til ribosomet , hvor cellens proteiner syntetiseres . Det er derfor et mellommolekyl mellom DNA og protein, og navnet "budbringer" er fullstendig beskrivende. I eukaryoter syntetiseres mRNA i nukleoplasmaet til cellekjernen og hvor det behandles før det får tilgang til cytosolen , der ribosomer finnes, gjennom porene i kjernekappen .

overføre RNA

Transfer RNA (tRNA) er korte polymerer på omtrent 80 nukleotider, som overfører en spesifikk aminosyre til det voksende polypeptidet ; De binder seg til spesifikke steder på ribosomet under oversettelse. De har et spesifikt aminosyrebindingssted (3'-ende) og et antikodon dannet av en nukleotidtriplett som binder seg til det komplementære kodonet til mRNA via hydrogenbindinger. [ 29 ] Disse tRNA-ene, i likhet med andre typer RNA, kan posttranskripsjonelt modifiseres av enzymer. Modifikasjonen av noen av dens baser er avgjørende for dekodingen av mRNA og for å opprettholde den tredimensjonale strukturen til tRNA. [ 32 ]

Ribosomalt RNA

Ribosomalt RNA (rRNA) finnes kombinert med proteiner for å danne ribosomer, hvor det representerer omtrent 2/3 av dem. I prokaryoter inneholder den store underenheten til ribosomet to rRNA-molekyler og den lille underenheten en. I eukaryoter inneholder den større underenheten tre rRNA-molekyler og den mindre. I begge tilfeller, på rammeverket som utgjøres av mRNA-ene, er spesifikke proteiner assosiert. rRNA er svært rikelig og representerer 80 % av RNA som finnes i cytoplasmaet til eukaryote celler. [ 33 ] Ribosomale RNA er den katalytiske komponenten i ribosomer; de er ansvarlige for å skape peptidbindingene mellom aminosyrene til polypeptidet som dannes under proteinsyntese; De fungerer dermed som ribozymer .

Regulatoriske RNAer

Mange typer RNA regulerer genuttrykk ved å være komplementære til spesifikke områder av mRNA eller gener i DNA.

RNA-interferens

Interfererende RNA (RNAi) er RNA-molekyler som undertrykker uttrykket av spesifikke gener gjennom mekanismer kjent globalt som ribointerferens eller RNA-interferens. Interfererende RNA er små molekyler (20 til 25 nukleotider) som genereres ved fragmentering av lengre forløpere. De kan klassifiseres i tre store grupper: [ 34 ]

Mikro-RNA

Mikro -RNA (miRNA) er korte kjeder på 21 eller 22 nukleotider som finnes i eukaryote celler som er generert fra spesifikke forløpere kodet i genomet . Ved transkripsjon foldes de til intramolekylære hårnåler og binder seg deretter til enzymer for å danne et effektorkompleks som enten kan blokkere mRNA-translasjon eller akselerere nedbrytningen ved å starte med enzymatisk fjerning av poly A-halen. [ 35 ] [ 36 ]

Lite forstyrrende RNA

Små interfererende RNA-er (siRNA-er eller siRNA- er), som består av 20-25 nukleotider, produseres ofte ved spalting av virale RNA- er, men kan også være av endogen opprinnelse. [ 37 ] [ 38 ]​ Etter transkripsjon settes det sammen til et proteinkompleks kalt RISC ( RNA-indusert silencing complex ) som identifiserer det komplementære mRNA som er kuttet i to halvdeler som brytes ned av cellemaskineriet, og blokkerer dermed ekspresjonen av mRNA-genet [ 39 ]​ [ 40 ]​ [ 41 ]

Piwi-assosierte RNA-er

Piwi - assosierte RNA [ 42 ] er kjeder på 29-30 nukleotider, typisk for dyr ; de er generert fra lange enkeltstrengede (enkeltrådede) forløpere, i en prosess som er uavhengig av Drosha og Dicer . Disse små RNA-ene assosieres med en underfamilie av "Argonaut"-proteinene kalt Piwi- proteiner . Kimlinjeceller er aktive ; de antas å være et defensivt system mot transposoner og å spille en viss rolle i gametogenese . [ 43 ]​ [ 44 ]

Antisense RNA

Et antisense RNA er den komplementære (ikke-kodende) tråden til en mRNA (kodende) tråd. De fleste hemmer gener, men noen få aktiverer transkripsjon. [ 45 ] Antisense RNA pares med dets komplementære mRNA for å danne et dobbelttrådet molekyl som ikke kan oversettes og degraderes enzymatisk. [ 46 ] Introduksjon av et transgen som koder for et antisense-mRNA er en teknikk som brukes til å blokkere ekspresjonen av et gen av interesse. Et radioaktivt merket antisense-mRNA kan brukes til å vise nivået av gentranskripsjon i ulike celletyper. Noen antisense strukturelle typer er eksperimentelle, da de brukes som antisense-terapi .

Langt ikke-kodende RNA

Mange lange ikke-kodende RNA -er (lange ncRNA-er) regulerer genuttrykk i eukaryoter; [ 47 ] En av dem er Xist som dekker ett av de to X-kromosomene hos kvinnelige pattedyr , og inaktiverer det ( Barrs kropp ). [ 48 ] ​​Flere studier viser at det er aktivt på lave nivåer. I visse cellepopulasjoner er en fjerdedel av genene som koder for proteiner og 80 % av lncRNA-ene påvist i det menneskelige genomet tilstede i én eller ingen kopier per celle, siden det er en restriksjon i visse RNA-er. [ 49 ]

Riboswitch

En riboswitch er en del av mRNA (messenger ribonukleinsyre) som små molekyler kan binde seg til som påvirker genaktiviteten. [ 50 ] ​[ 51 ] ​[ 52 ]​ Derfor er et mRNA som inneholder en riboswitch direkte involvert i reguleringen av sin egen aktivitet som avhenger av tilstedeværelsen eller fraværet av signalmolekylet. Slike riboswitcher finnes i den 5'-utranslaterte regionen (5'-UTR), lokalisert før startkodonet (AUG), og/eller i den 3'-utranslaterte regionen (3'-UTR), også kalt drag-sekvensen. , [ 17 ] lokalisert mellom stoppkodonet (UAG, UAA eller UGA) og poly A-halen. [ 52 ]

RNA med katalytisk aktivitet

Ribozymes

RNA kan fungere som en biokatalysator . Visse RNA-er er assosiert med proteiner som danner ribonukleoproteiner , og det er bevist at det er RNA-underenheten som utfører de katalytiske reaksjonene; disse RNA-ene utfører reaksjonene in vitro i fravær av protein. Fem typer ribozymer er kjent; tre av dem utfører selvmodifikasjonsreaksjoner, som intronfjerning eller selvskjæring, mens de andre ( ribonuklease P og ribosomalt RNA) virker på forskjellige underlag. [ 17 ] Således spalter ribonuklease P et forløper-RNA til tRNA-molekyler, [ 53 ] mens ribosomalt RNA utfører peptidbinding under ribosomalt proteinsyntese.

Spleisosom

Intronene separeres fra pre-mRNA under prosessen kjent som spleising av spleiseosomer , som inneholder mange små kjernefysiske RNA (snRNA). [ 54 ] I andre tilfeller fungerer intronene selv som ribozymer og skiller seg fra eksonene . [ 55 ]

lite nukleolært RNA

Små nukleolære RNA- er (snRNA-er), funnet i nukleolus- og Cajal-legemene , styrer nukleotidmodifikasjonen av andre RNA-er; [ 29 ] Prosessen består i å transformere en av de fire typiske nitrogenholdige basene (A, C, U, G) til andre. sRNA-er assosieres med enzymer og veileder dem ved å pare med spesifikke sekvenser av RNA-en de vil modifisere. rRNA og tRNA inneholder mange modifiserte nukleotider. [ 56 ]​ [ 57 ]

Mitokondrier har sitt eget proteinsynteseapparat , som inkluderer rRNA (i ribosomene), tRNA og mRNA. Mitokondrielle RNA -er (mtRNA eller mtRNA-er) står for 4% av totalt cellulært RNA. De blir transkribert av en spesifikk mitokondriell RNA-polymerase . [ 17 ]

RNA-genomer

DNA er molekylet som bærer genetisk informasjon i alle cellulære organismer, men som DNA kan RNA lagre genetisk informasjon. RNA - virus mangler fullstendig DNA, og genomet deres består av RNA, som koder for virusproteinene, slik som kapsidens og noen enzymer. Disse enzymene utfører replikasjonen av det virale genomet. Viroider er en annen klasse patogener som utelukkende består av et RNA-molekyl som ikke koder for noe protein og som er replikert av vertscellemaskineriet . [ 58 ]

RNA verdenshypotese

RNA-verdenshypotesen foreslår at RNA var den første nukleinsyren som dukket opp på jorden, og deretter foran DNA, og i sin tur ville disse nukleinsyrene sammen med proteiner , når de ble koblet sammen med spontant dannede liposomer , danne de første cellene. Den er basert på verifikasjonen av at RNA kan inneholde genetisk informasjon, på lignende måte som DNA, og at noen typer er i stand til å utføre metabolske reaksjoner, som for eksempel selvskjæring eller dannelse av peptidbindinger.

I årevis var det spekulasjoner om hva som kom først, DNA eller enzymer, siden enzymer syntetiseres fra DNA og DNA-syntese utføres av enzymer. Hvis det antas at de første livsformene brukte RNA både til å lagre sin genetiske informasjon og for å utføre metabolismen, er denne hindringen overvunnet. Eksperimenter med grunnleggende ribozymer, som det virale RNA Q-beta , har vist at enkle selvreplikerende RNA-strukturer kan motstå selv sterke selektive trykk (som kjedeterminatorer med motsatt kiralitet ). [ 59 ]

Se også

Referanser

  1. ↑ Barioglio, Carlos Fernando (2013). Ordbok over animalsk produksjon. Utgave . Brugge forlag. ISBN  9789879452561 . Hentet 1. oktober 2019 . 
  2. ↑ Biokjemi: Lærebok med kliniske anvendelser , s. 78. På Google Books.
  3. ↑ Test av opptak til universitetet i mer enn 25 år. Biologispesifikk test.e-bok . MAD-Eduforma. ISBN  9788466517775 . Hentet 1. oktober 2019 . 
  4. ^ Dahm, R. (2005). "Friedrich Miescher og oppdagelsen av DNA". Developmental Biology 278 (2): 274-88. PMID  15680349 . doi : 10.1016/j.ydbio.2004.11.028 . 
  5. ↑ Caspersson, T., Schultz, J. (1939). "Pentosenukleotider i cytoplasmaet til voksende vev". Nature 143 : 602-3. doi : 10.1038/143602c0 . 
  6. ^ Ochoa, S. (1959). "Enzymatisk syntese av ribonukleinsyre" . Nobelforelesning . 
  7. ↑ Holley, RW et al (1965). "Struktur av en ribonukleinsyre". Science 147 (1664): 1462-65. PMID  14263761 . doi : 10.1126/science.147.3664.1462 . 
  8. ^ Siebert, S. (2006). "Felles sekvensstrukturegenskaper og stabile regioner i RNA-sekundære strukturer" . Dissertation, Albert-Ludwigs-Universität, Freiburg im Breisgau . s. 1. Arkivert fra originalen 9. mars 2012. 
  9. ^ Szathmary, E. (1999). "Opprinnelsen til den genetiske koden: aminosyrer som kofaktorer i en RNA-verden". Trender Genet. 15 (6): 223-9. PMID  10354582 . doi : 10.1016/S0168-9525(99)01730-8 . 
  10. ↑ Fiers, W. et al (1976). "Fullstendig nukleotidsekvens av bakteriofag MS2-RNA: primær og sekundær struktur av replikasegen". Nature 260 : 500-7. PMID  1264203 . doi : 10.1038/260500a0 . 
  11. ^ Napoli, C., Lemieux, C. & Jorgensen, R. (1990). "Innføring av et kimært chalcone syntasegen i petunia resulterer i reversibel co-undertrykkelse av homologe gener i trans" . PlantCell 2 (4): 279-89. PMID  12354959 . doi : 10.1105/tpc.2.4.279 . 
  12. ^ Dafny-Yelin, M., Chung, SM, Frankman, EL & Tzfira, T. (desember 2007). "pSAT RNA-interferensvektorer: en modulær serie for nedregulering av flere gener i planter" . Plant Physiol. 145 (4): 1272-81. PMC  2151715 . PMID  17766396 . doi : 10.1104/pp.107.106062 . 
  13. ^ Ruvkun, G. (2001). "Glimt av en liten RNA-verden". Science 294 (5543): 797-99. PMID  11679654 . doi : 10.1126/science.1066315 . 
  14. ^ Fichou, Y. & Ferec, C. (2006). "Oligonukleotiders potensial for terapeutiske anvendelser" . Trends in Biotechnology 24 (12): 563-70. PMID  17045686 . doi : 10.1016/j.tibtech.2006.10.003 . 
  15. ^ a b Lee, JC & Gutell, RR (2004). "Mangfold av baseparkonformasjoner og deres forekomst i rRNA-struktur og RNA-strukturelle motiver". J. Mol. Biol. 344 (5): 1225-49. PMID  15561141 . doi : 10.1016/j.jmb.2004.09.072 . 
  16. ^ Barciszewski, J., Frederic, B. & Clark, C. (1999). RNA-biokjemi og bioteknologi . Springer. s. 73-87. ISBN  0792358627 . OCLC  52403776 . 
  17. ↑ a b c de Devlin , TM 2004. Biochemistry , 4. utgave. Jeg snudde, Barcelona. ISBN 84-291-7208-4
  18. ^ Watson, JD, & Crick, FH (1953). "Molekylær struktur av nukleinsyrer: En struktur for deoksyribose nukleinsyre". Nature 171 : 737-738. 
  19. ^ Brown, T. (2004). Genomer . Pan American Medical Ed. 
  20. ^ Fontana, W. (2002). "Modellering "evo-devo" med RNA. BioEssays: News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology 24 (12): 1164-77. doi : 10.1002/bies.10190 . 
  21. ↑ Tabell satt sammen i Quinones Olvera, N. Evolusjonære implikasjoner av RNA-plastisitet .  (Avhandling) National Autonomous University of Mexico
  22. ^ Salazar, M., Fedoroff, OY, Miller, JM, Ribeiro, NS, Reid, BR (1992). "DNA-tråden i DNAoRNA-hybridduplekser er verken B-form eller A-form i løsning". Biokjemi . 32 nummer=16: 4207-15. PMID  7682844 . doi : 10.1021/bi00067a007 . 
  23. ^ Hermann, T. & Patel, D.J. (2000). RNA buler ut som arkitektoniske og gjenkjennende motiver. Struktur 8 (3): R47–R54. PMID  10745015 . doi : 10.1016/S0969-2126(00)00110-6 . 
  24. ↑ Mikkola, S., Nurmi, K., Yousefi-Salakdeh, E., Strömberg, R. & Lönnberg, H. (1999). "Mekanismen til metallionet fremmet spaltning av RNA-fosfodiesterbindinger involverer en generell syrekatalyse av metall-aquo-ionet ved avgang av den utgående gruppen." Perkin Transactions 2 : 1619-26. doi : 10.1039/a903691a . 
  25. ^ Nudler, E. & Gottesman, ME (2002). "Transkripsjonsavslutning og antiterminering i E. coli ". Genes to Cells 7 : 755-68. PMID  12167155 . doi : 10.1046/j.1365-2443.2002.00563.x . 
  26. ^ Hansen, JL, Long, AM & Schultz, SC (1997). "Struktur av den RNA-avhengige RNA-polymerase av poliovirus". Struktur 5 (8): 1109-22. PMID  9309225 . doi : 10.1016/S0969-2126(97)00261-X . 
  27. ↑ Ahlquist, P. (2002). "RNA-avhengige RNA-polymeraser, virus og RNA-demping". Science 296 (5571): 1270-73. PMID  12016304 . doi : 10.1126/science.1069132 . 
  28. ^ Cooper, G.C., Hausman, R.E. (2004). The Cell: A Molecular Approach (3. utgave). Sinauer. s. 261-76, 297, 339-44. ISBN  0-87893-214-3 . OCLC  174924833 52121379 52359301 56050609 . 
  29. ↑ abc Wirta , W. ( 2006). Utvinning av transkriptomet – metoder og applikasjoner . Stockholm: Högskolan för bioteknologi, Kungliga Tekniska Högskolan. ISBN  91-7178-436-5 . OCLC  185406288 . 
  30. ↑ Rossi JJ (2004). Ribozyme-diagnostikk blir myndig. Chemistry & Biology 11 (7): 894-95. doi : 10.1016/j.chembiol.2004.07.002 . 
  31. ↑ Nissen, P., Hansen, J., Ban, N., Moore, PB, Steitz, TA (2000). "Det strukturelle grunnlaget for ribosomaktivitet i peptidbindingssyntese". Science 289 (5481): 920-30. PMID  10937990 . doi : 10.1126/science.289.5481.920 . 
  32. ↑ Grosjean, H. (2009) Nukleinsyrer er ikke kjedelige lange polymerer av
    bare fire typer nukleotider: en guidet tur. DNA- og RNA-
    modifikasjonsenzymer: struktur, mekanisme, funksjon og
    evolusjon. Landes Biosciences, Texas, USA, s. 1–18.
  33. ^ Kampers, T., Friedhoff, P., Biernat, J., Mandelkow, E.-M., Mandelkow, E. (1996). "RNA stimulerer aggregering av mikrotubuli-assosiert protein tau til Alzheimer-lignende parede spiralfilamenter". FEBS Letters 399 :104D. PMID  8985176 . doi : 10.1016/S0014-5793(96)01386-5 . 
  34. ↑ Grosshans, H. & Filipowicz, W. 2008. Molecular biology: the expanding world of small RNAs. Nature , 451(7177):414-6 [1]
  35. ↑ Wu, L., Belasco, JG (januar 2008). "La meg telle måtene: mekanismer for genregulering av miRNA og siRNA". Mol. Celle 29 (1): 1-7. PMID  18206964 . doi : 10.1016/j.molcel.2007.12.010 . 
  36. ↑ Matzke MA, Matzke AJM (2004). Planter frøene til et nytt paradigme. PLoS Biology 2 (5): e133 |página=og |páginas=redundant ( hjelp ) . PMID  15138502 . doi : 10.1371/journal.pbio.0020133 . 
  37. ↑ Vázquez, F., Vaucheret, H., Rajagopalan, R., Lepers, C., Gasciolli, V., Mallory, AC, Hilbert, J., Bartel, DP & Crété, P. (2004). "Endogene trans -virkende siRNA-er regulerer akkumuleringen av Arabidopsis - mRNA-er". Molecular Cell 16 (1): 69-79. PMID  15469823 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.028 . 
  38. ↑ Watanabe, T., Totoki, Y., Toyoda, A., et al (mai 2008). "Endogene siRNA-er fra naturlig dannede dsRNA-er regulerer transkripsjoner i museoocytter". Nature 453 (7194): 539-43. PMID  18404146 . doi : 10.1038/nature06908 . 
  39. ^ Sontheimer, EJ, Carthew, RW (juli 2005). "Stillhet innenfra: endogene siRNAer og miRNAer". Celle 122 (1): 9-12. PMID  16009127 . doi : 10.1016/j.cell.2005.06.030 . 
  40. ^ Doran, G. (2007). "RNAi - Er ett suffiks tilstrekkelig?" . Journal of RNAi and Gene Silencing 3 (1): 217-19. Arkivert fra originalen 16. juli 2007. 
  41. ↑ Pushparaj, PN, Aarthi, JJ, Kumar, SD, Manikandan, J. (2008). "RNAi og RNAa - Yin og Yang av RNAome" . Bioinformasjon 2 (6): 235-7. PMC  2258431 . PMID  18317570 . 
  42. ^ Hartig, JV, Tomari, Y., Forstemann, K. (2007). "piRNAs - de eldgamle jegerne av genominntrengere." Genes Dev. 21 (14). 1707-13 . [to] 
  43. ^ Horwich, MD, Li, C., Matranga, C., Vagin, V., Farley, G., Wang, P, & Zamore, PD (2007). " Drosophila RNA-metyltransferase, DmHen1, modifiserer kimlinje-piRNA-er og enkelttrådede siRNA-er i RISC". Current Biology 17 : 1265-72. PMID  17604629 . doi : 10.1016/j.cub.2007.06.030 . 
  44. ^ Girard, A., Sachidanandam, R., Hannon, G.J. & Carmell, M.A. (2006). "En kimlinjespesifikk klasse av små RNA-er binder pattedyrs Piwi-proteiner". Nature 442 : 199-202. PMID  16751776 . doi : 10.1038/nature04917 . 
  45. ^ Wagner, EG, Altuvia, S., Romby, P. (2002). "Antisense RNA i bakterier og deres genetiske elementer". Adv Genet. 46 : 361-98. PMID  11931231 . doi : 10.1016/S0065-2660(02)46013-0 . 
  46. ↑ Gilbert, S. F. (2003). Utviklingsbiologi (7. utgave). Sinauer. s. 101–3 . ISBN  0878932585 . OCLC  154656422 154663147 174530692 177000492 177316159 51544170 54743254 59197768 61404850 66754122 . 
  47. ↑ Amaral, PP, Mattick, JS (oktober 2008). "Ikke-kodende RNA i utvikling". Pattedyrgenom: offisielt tidsskrift for International Mammalian Genome Society 19 : 454. PMID  18839252 . doi : 10.1007/s00335-008-9136-7 . 
  48. ^ Heard, E., Mongelard, F., Arnaud, D., Chureau, C., Vourc'h, C. & Avner, P. (1999). "Humane XIST- gjær kunstige kromosomtransgener viser delvis X-inaktiveringssenterfunksjon i embryonale stamceller fra mus". proc. Natl. Acad. Sci. USA 96 (12): 6841-46. PMID  10359800 . doi : 10.1073/pnas.96.12.6841 . 
  49. ^ Djebali (2012). Landskap for transkripsjon i menneskelige celler (489). s. 101-108 . Hentet 13. mars 2015 . 
  50. ↑ Tucker, BJ, Breaker, RR (2005). "Riboswitcher som allsidige genkontrollelementer". Curr Opin Struct Biol 15 (3): 342-8. PMID  15919195 . doi : 10.1016/j.sbi.2005.05.003 . 
  51. ↑ Vitreschak, AG, Rodionov, DA, Mironov, AA & Gelfand, MS (2004). "Riboswitcher: den eldste mekanismen for regulering av genuttrykk?". Trender Genet 20 (1): 44-50. PMID  14698618 . doi : 10.1016/j.tig.2003.11.008 . 
  52. ↑ a b Batey, RT (2006). "Strukturer av regulatoriske elementer i mRNA". Curr Opin Struct Biol 16 (3): 299-306. PMID  16707260 . doi : 10.1016/j.sbi.2006.05.001 . 
  53. ^ Guerrier-Takada, C., Gardiner, K., Marsh, T., Pace, N. & Altman, S. (1983). "RNA-delen av ribonuklease P er den katalytiske underenheten til enzymet". Celle 35 (3 Pt 2): 849-57. PMID  6197186 . doi : 10.1016/0092-8674(83)90117-4 . 
  54. ^ Berg, JM, Tymoczko, JL, Stryer, L. (2002). Biokjemi (5. utgave). W. H. Freeman og Company. s. 118-19, 781-808. ISBN  0-7167-4684-0 . OCLC  179705944 48055706 59502128 . 
  55. ^ Steitz, TA, Steitz, JA (1993). "En generell to-metallion-mekanisme for katalytisk RNA". proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (14): 6498-502. PMID  8341661 . doi : 10.1073/pnas.90.14.6498 . 
  56. ↑ J. Xie, M. Zhang, T. Zhou, X. Hua, L. Tang, W. Wu (2007). Sno/scaRNAbase: en kuratert database for små nukleolære RNA-er og cajal-kroppsspesifikke RNA-er. Nucleic Acids Res. 35 : D183-7. PMID  17099227 . doi : 10.1093/nar/gkl873 . 
  57. ↑ Omer, AD, Ziesche, S., Decatur, WA, Fournier, MJ, Dennis, PP (2003). "RNA-modifiserende maskiner i arkea". Molecular Microbiology 48 (3): 617-29. PMID  12694609 . doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03483.x . 
  58. ↑ Daròs, JA, Elena. SF, Flores, R. (2006). "Viroider: en Ariadnes tråd inn i RNA-labyrinten". EMBO Rep. 7 (6): 593-8. PMID  16741503 . doi : 10.1038/sj.embor.7400706 . 
  59. ^ Bell, G. 1997. Grunnleggende om valg . Springer, London, 378 s. ISBN 412 055317

Eksterne lenker