Haplogruppe M (mtDNA)

I menneskelig genetikk er haplogruppe M en mitokondriell haplogruppe hvis etterkommere er spredt over alle kontinenter, og er dominerende i Øst- Eurasia . Den er omtrent 60 000 til 65 000 år gammel og har sannsynligvis sin opprinnelse i India . Det er definert av de genetiske markørene 489, 10400, 14783 og 15043.

Gitt sin brede globale distribusjon, kalles den også makrohaplogruppe M* , og i likhet med haplogruppe N* er den avledet fra haplogruppe L3 . Den teller blant sine etterkommere haplogruppene C , Z , D , E , G , Q og mange undergrupper av M.

Opprinnelse

Opprinnelsen til haplogruppe M , som N , er relatert til utvidelsen av Homo sapiens ut av Afrika. Det er sannsynlig at L3 - bosettere først forlot Nordøst-Afrika (Etiopia) gjennom det nære østen og, da de ankom India for 60 000 år siden, ga opphav til haplogruppe M. Den hindustanske opprinnelsen er forsterket av det store antallet avledede gamle haplogrupper. av M som er tilstede i Sør-Asia ; [ 1 ] Det er også i India og Bangladesh hvor den høyeste konsentrasjonen av makrohaplogruppe M* finnes, med frekvenser fra 60 til 80 % av befolkningen. [ 2 ]

Forløperbefolkningen til denne gruppen bebodd under istiden kalt Würm/Wisconsin , den siste kjente av jorden som avslutter Pleistocen , også kalt den "antropologiske istiden" som begynte for 100 000 år siden og sluttet for 10 000 år siden. M finner sted i sør . regioner, som selv i denne perioden hadde klima like godartet og tropisk som de i Afrika hvor de kom fra. Denne regionen løp på et kontinuum fra Indusdalen til Sundaland ( Sørøst-Asia ), og var svært gunstig for befolkningsvekst, slik at et lignende tilfelle av rask genetisk diversifisering sannsynligvis ikke eksisterte i paleolitikum; som bevist av de mange etterkommerne av M representert av minst 44 oppdagede klader som allerede er godt definert. [ 3 ]

Spredning

Fra India er det en hovedsakelig kystutvidelse mot Sørøst-Asia av etterkommerne av M sammen med andre etterkommere av N, og derfra fortsetter en påfølgende ekspansjon mot Øst-Asia (Kina) på den ene siden og den andre mot Sahul (Australia) for annen; dermed representerer disse populasjonene den første Homo sapiens som koloniserte disse regionene og utgjør samtidig grunnlaget for opprinnelsen til de nåværende innfødte populasjonene i Fjernøsten og Oseania .

I motsatt retning ville en migrasjon som brakte M1 -haplogruppen til det nære østen returnere til Afrika, noe som er relatert til utvidelsen av afroasiatiske språk , [ 4 ] selv om noen forfattere vurderte M1 av ikke-indisk opprinnelse på grunn av mulig utseende av parallelle språk. mutasjoner, [ 5 ] ville dette være forvrengt siden M1 i realiteten er en undergruppe som ville nedstamme fra kladen M1'20'51, som også har et forhold til migrasjonene som gikk til Fjernøsten. Bevis tyder på at M1 koloniserer Afrika under yngre steinalder. [ 6 ]

Mange av de første amerikanske nybyggerne , som kommer fra Sibir , stammer fra makrohaplogruppe M (undergruppe C og D ) og kan godt ha vært de første som koloniserte Amerika; fordi i det ekstreme sør i Sør-Amerika nærmer frekvensen seg 100 % i innfødte populasjoner som Mapuches , Patagonians og Fueguinos . En rekke haplogruppe M ble til og med funnet i rester av indiske nybyggere i British Columbia fra 5000 år siden, [ 7 ] samt de eldste genetisk analyserte restene, funnet på Prince of Wales Island (Stillehavskysten av Alaska) for 10 300 år siden. [ 8 ]

Undergrupper av M* og deres distribusjon

Haplogruppe M (489 10400 14783 15043) og dens etterkommere haplogrupper er relatert som følger: [ 9 ]


Se også

Haplogrupper av humant mitokondrielt DNA

  Mitokondriell Eva ( L )    
L0 L1-6
L1 L2 L3   L4 L5 L6
  M N  
CZ D OG G Q   EN ja   R   Yo W X Y
C Z B. F R0   JT P  ELLER
HV J T K
H v


Eksterne lenker

Referanser

  1. ^ Rajkumar et al. (2005), Phylogeny and antiquity of M macrohaplogroup utledet fra fullstendig mt DNA-sekvens av indiske spesifikke linjer , BMC Evolutionary Biology 2005, 5:26 doi:10.1186/1471-2148-5-26
  2. a b c de Thangaraj et al. (2006), In situ opprinnelse til dype forankringslinjer av mitokondriell makrohaplogruppe 'M' i India , BMC Genomics 2006, 7:151
  3. PhyloTree.org - mtDNA-undertre M Arkivert 2010-05-12 på Wayback Machine . Fylogenetisk tre av M fra van Oven M & Kayser M. 2009
  4. a b Olivieri et al. (2006), mtDNA-arven fra den levantinske tidlige øvre paleolitikum i Afrika , vitenskap. 2006 15. desember;314(5806):1767-70
  5. a b Sun et al. (2006), The Dazzling Array of Basal Branches in the mtDNA Macrohaplogroup M fra India as inferred from Complete Genomes , Molecular Biology and Evolution 2006 23(3):683-690; doi:10.1093/molbev/msj078
  6. Gonzalez et al. (2007), Mitokondriell avstamning M1 sporer en tidlig menneskelig tilbakestrømning til Afrika, BMC Genomics 2007, 8:223 doi:10.1186/1471-2164-8-223
  7. R. Malhi et al. 2006 Mitokondriell haplogruppe M oppdaget i forhistorisk North Americans Journal of Archaeological Science xx (2006) 1-7
  8. Kemp, Brian et al 2007, Genetisk analyse av tidlige holocene skjelettrester fra Alaska og dets implikasjoner for bosetningen i Amerika
  9. a b av Oven M, Kayser M. 2009. Oppdatert omfattende fylogenetisk tre av global human mitokondriell DNA-variasjon. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org , mtDNA-tre Build 2 (14. oktober 2008)
  10. a b c Ana M González et al 2007. Mitokondriell avstamning M1 sporer en tidlig menneskelig tilbakestrømning til Afrika BMC Genomics. 2007; 8:223.
  11. a b c d e Kong, Qing-Peng et al 2010, storskala mtDNA-screening avslører en overraskende matrilineal kompleksitet i Øst-Asia og dens implikasjoner for befolkningen i regionen
  12. Hartmann et al. 2009, Validering av mikroarray-basert resekvensering av 93 verdensomspennende mitokondrielle genomer.
  13. Kumar S. et al 2008, De tidligste nybyggernes antikke og evolusjonære historie for indiske befolkninger: bevis fra M2 mtDNA-avstamning. BMC Evolutionary Biology 2008, 8:230 doi:10.1186/1471-2148-8-230
  14. a b c d Metspalu et al. 2004-05. "De fleste av de eksisterende mtDNA-grensene i Sør- og Sørvest-Asia ble sannsynligvis formet under den første bosettingen av Eurasia av anatomisk moderne mennesker"
  15. a b Maji S et al. 2009, Fylogeografisk distribusjon av mitokondriell DNA-makrohaplogruppe M i India Indian Academy of Sciences. J. Genet. 88, 127–139
  16. a b c d e f g h i j k l m n ñ o p q Chandrasekar et al 2009, Update Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup M in India: Dispersal of Modern Human in South Asian Corridor. PLoS ONE 4(10): e7447. doi:10.1371/journal.pone.0007447
  17. a b c Fornarino, Simona et al 2009, Mitokondriell og Y-kromosomdiversitet i Tharus (Nepal): et reservoar av genetisk variasjon.
  18. Haplogroup M4 , Ian Logan 2010
  19. ^ abc Witas , Henryk W.; Jacek Tomczyk; Krystyna Jędrychowska-Dańska; Gyaneshwer Chaubey & Tomasz Płoszaj (2013) " mtDNA fra tidlig bronsealder til romertiden antyder en genetisk kobling mellom det indiske subkontinentet og den mesopotamiske sivilisasjonens vugge "; PLOS ONE , 11. september 2013. DOI: 10.1371/journal.pone.0073682.
  20. a b c Scholes, Clarissa et al 2011, Genetisk mangfold og bevis for populasjonsblanding i Batak Negritos fra Palawan
  21. Logan I. 2009 Haplogroup M5
  22. Malyarchuk, BA et al 2005, Mitokondriell DNA-mangfold i det polske Roma
  23. a b Han-Jun Jin et al. 2008, The People of Korea avslørt ved analyser av mitokondrielt DNA og Y-kromosomale markører
  24. a b Masashi Tanaka et al. 2004, Mitokondriell genomvariasjon i Øst-Asia og befolkningen i Japan. Genome Res. 2004. 14: 1832-1850
  25. Derenko M. et al 2007, Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations. AjHG 81 , utgave 5, nov 2007, 1025-1041
  26. Soares et al. (2008), Climate Change and Postglacial Human Dispersals in Southeast Asia , Molecular Biology and Evolution, juni 2008; 25: 1213
  27. a b Zhao, Mian et al 2009, bevis for mitokondrielt genom avslører vellykket sen paleolittisk bosetning på det tibetanske platået.
  28. Dancause K. et al 2009, Origins of the Moken Sea Gypsies utledet fra mitokondriell hypervariabel region og hele genomsekvenser.
  29. a b Abu-Amero, Khaled K et al 2008, Mitokondriell DNA-struktur på den arabiske halvøy og tilleggsfiler BMC Evol Biol. 2008; 8:45
  30. Hudjashov, G. et al 2007 Avsløre den forhistoriske bosetningen i Australia ved Y-kromosom- og mtDNA-analyse.
  31. ^ a b Hill, C. et al 2007, A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia.
  32. Hill, Catherine et al. 2006, Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians , Mol. Biol.Evol. 23(12):2480–2491. 2006 doi:10.1093/molbev/msl124.
  33. Pierson, M. et al. 2006, Deciphering Past Human Population Movements in Oceania: Proably Optimal Trees of 127 mtDNA Genomes.
  34. a b Ricaut, François et al. 2009, En ny dyp gren av eurasisk mtDNA makrohaplogruppe M avslører ytterligere kompleksitet angående bosettingen av Madagaskar BMC Genomics 2009, 10:605 doi:10.1186/1471-2164-10-605
  35. Gunnarsdóttir, Ellen Dröfn et al 2001b, Større mitokondriell DNA enn Y-kromosomforskjeller mellom matrilokale og patrilokale grupper fra Sumatra
  36. a b Merriwether, D. Andrew et al 2005, Ancient mitochondrial M haplogroups identified in the Southwest Pacific. PNAS 13. september 2005 102 37, 13034-13039
  37. ^ a b c Friedlaender, Jonathan et al 2007, Melanesian mtDNA Complexity.
  38. Tommaseo-Ponzetta et al. 2002. Mitokondriell DNA-variabilitet i West New Guinea-populasjoner. Am J Phys Anthropol 117:49-67.
  39. a b Endicott, Ph. et al. 2006, Multipleks SNP-typing av gammelt DNA klargjør opprinnelsen til Andaman mtDNA-haplogrupper blant sørasiatiske stammepopulasjoner.
  40. a b c Reddy et al 2007, østerriksk-asiatiske stammer i Nordøst-India gir hittil manglende genetisk kobling mellom Sør- og Sørøst-Asia.
  41. Malyarchuk, B. et al 2008c, Mitochondrial DNA Variability in Slovaks, with Application to the Roma Origin,
  42. Kumar, Satish et al 2009, Rekonstruksjon av indisk-australsk fylogenetisk kobling
  43. Mona, Stefano et al 2009, Genetisk blandingshistorie i østlige Indonesia som avslørt av Y-kromosom og mitokondriell DNA-analyse Mol Biol Evol (2009) doi: 10.1093/molbev/msp097
  44. Gunnarsdóttir, Ellen et al 2010, High-throughput-sekvensering av komplette humane mtDNA-genomer fra Filippinene
  45. Logan 2008, Haplogroup M48