PVC gruppe

PVC
Chlamydia trachomatis infiserer kulturceller.
taksonomi
Domene :	Bakterie
(ingen rekkevidde)	Gracilicutes
Superedge:	PVC-gruppe [ 1 ]​ eller Planctobacteria
skarpe kanter
Planctomycetes Chlamydiae/Verrucomicrobia Group Klamydiae Verrukomikrobielt kandidater: Omnitrofisk Aureabakterier Submerlaeota Ratteibakterier Coatesbakterier porybakterier i slekt: desinfeksjon elusimikrobiell porybakterier gullbakterier Brannsteinbakterier

PVC-gruppen eller Planctobacteria er en gruppe bakterier som vanligvis tildeles kategorien superphylum . Den er inkludert i bakteriekladen Gracilicutes og omfatter phyla Planctomycetes , Chlamydiae , Verrucomicrobia og noen få kandidat-phyla. Taksonet ble opprettet av Cavalier-Smith basert på antakelsen om at Planctobacteria reduserte eller mistet peptidoglykan fra celleveggen to ganger. [ 2 ]​ [ 3 ]​ Cavalier-Smith (2020) gir den en rekkephylum og inkluderte også phylum Elusimicrobia på grunnlag av hans fylogenetiske analyse og andre. [ 4 ] Noen fylogenetiske analyser fjerner imidlertid Elusimicrobia fra PVC.

I følge NCBI ligner Chlamydiae/Verrucomicrobia- gruppen PVC-gruppen, men inkluderer ikke Planctomycetes. [ 5 ]​ [ 6 ]

En noe omforent fylogeni i GTDB-databasen og Annotree er som følger: [ 7 ] [ 8 ]

	desinfeksjon         gullbakterier     Brannsteinbakterier       elusimikrobiell       PVC gruppe       Submerlaeota     porybakterier         Coatesbakterier     Planctomycetes             Ratteibakterier     Omnitrofisk         Aureabakterier       Klamydiae     Verrukomikrobielt

Referanser

1. ↑ Kamneva OK et al 2012. Analyse av evolusjon av genominnhold i pvc bakteriell super-fylum: vurdering av kandidatgener assosiert med cellulær organisering og livsstil. Genom Biol Evol. 2012;4(12):1375-90. doi: 10.1093/gbe/evs113.
2. ^ Cavalier-Smith T (2006). "Cellevolusjon og jordhistorie: stasis og revolusjon" . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 361 (1470): 969-1006. PMID  16754610 .   ( brutt lenke tilgjengelig på Internet Archive ; se historikk , første og siste versjon ).
3. ↑ Thomas Cavalier-Smith (2006), Rooting the tree of life by overgangsanalyser , Biol Direct. 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19.
4. ↑ Thomas Cavalier-Smith & Ema E-Yung Chao (2020). Multidomene ribosomale proteintrær og den planktobakterielle opprinnelsen til neomura (eukaryoter, arkebakterier) . Linkspringer.
5. ↑ Chlamydiae/Verrucomicrobia group NCBI Taxonomy Browser
6. ↑ Radhey S. Gupta et al 2012. Molekylære signaturer for PVC-kladen (Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae og Lentisphaerae) av bakterier gir innsikt i deres evolusjonære forhold foran mikrobiol. 2012; 3: 327.
7. ↑ Mendler, K; Chen, H.; Parks, D.H.; Hugh, LA; Doxey, A.C. (2019). "AnnoTree: visualisering og utforskning av et funksjonelt kommentert mikrobielt livets tre" . Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC  6511854 . PMID  31081040 . doi : 10.1093/nar/gkz246 . 
8. ^ "GTDB utgivelse 05-RS95" . Genomtaksonomidatabase .