Preplasmaviricota

Preplasmaviricota
Virioner av et tectivirus og et adenovirus .
Klassifisering av virus
Domene :	Varidnaviria
Kongerike :	Bamfordvirae
Filo :	Preplasmaviricota

Preplasmaviricota er en filum av DNA-virus i Varidnaviria- domenet og Bamfordvirae- riketsom inkluderer virofagene , adenovirusene sammen med noen familier av prokaryote virus . Sistnevnte spilte en rolle i utviklingen av polynton- DNA-transposon- superfamilien , mitokondrielle plasmider og cytoplasmatiske plasmider i eukaryoter gjennom virusinfeksjoner, basert på fylogenetiske analyser av DNA-polymerase . Den inneholder 8 virusfamilier og en er under vurdering. [ 1 ]​ [ 2 ]

Fylogenetisk er denne filumen parafyletisk fordi de gigantiske virusene ( Nucleocytoviricota phylum) vil stamme fra de små virusene i dette settet , og øke dets genom og størrelsen på virionet gjennom duplisering og sletting av gener, inkludering av mobile genetiske elementer og den massive anskaffelse av gener fra verten og dens endosymbiotiske bakterier , inkludert gener for translasjon og databehandlingsgener som anses som de mest motstandsdyktige mot horisontal overføring. [ 3 ]​ [ 4 ]​ [ 5 ]​ [ 6 ]​ [ 7 ]​ Selv om det er et parafyletisk takson, kan det brukes til viral taksonomi fordi taxaene er relatert til hverandre og deler unike karakterer som skiller dem fra virusgiganter.

Taksonomi

Taksonomien etablert av ICTV er som følger: [ 8 ]

• Phylum Preplasmaviricota
  • Familie Lavidaviridae
  • Familie Adintoviridae
  • Familie Finnlakeviridae [ 9 ]
  • Klasse Tectiliviricetes
    • Familie Adenoviridae
    • Familien Tectiviridae
    • Familien Turriviridae
    • Bestill Vinavirales
      • Familie Corticoviridae
      • Familien Autolykiviridae

Referanser

1. ^ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18. oktober 2019). "Lag et megataksonomisk rammeverk, som fyller alle viktigste taksonomiske rekker, for DNA-virus som koder for vertikale hovedkapsidproteiner av gelérulltype" (docx) . Den internasjonale komiteen for taksonomi av virus . Hentet 10. juni 2020 . 
2. ^ Kauffman KM, Hussain FA, Yang J, Arevalo P, Brown JM, Chang WK, VanInsberghe D, Elsherbini J, Sharma RS, Cutler MB, Kelly L, Polz MF (1. februar 2018). "En stor avstamning av ikke-halede dsDNA-virus som ukjente mordere av marine bakterier". Nature 554 (7690): 118-122. PMID  29364876 . doi : 10.1038/nature25474 . 
3. ↑ Natalya Yutin, Eugene Koonin (2019). Kapittel fem - Evolusjon av de store nukleocytoplasmatiske DNA-virusene til eukaryoter og konvergent opprinnelse til viral gigantisme . ScienceDirect.
4. ↑ Natalya Yutin, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin (2014). Opprinnelsen til gigantiske virus fra mindre DNA-virus ikke fra et fjerde domene av cellelivet . ScienceDirect. https://doi.org/10.1016/j.virol.2014.06.032
5. ↑ Jonathan Filee (2013). Rute for NCLDV-evolusjon: det genomiske trekkspillet . ScienceDirect.
6. ↑ David Moreira, Céline Brochier-Armanet (2008). Kjempevirus, gigantiske kimærer: De mange evolusjonshistoriene til mimivirusgener. NCBI.
7. ↑ Tom Williams, T Martin Embley, Eva Heinz (2011). Informasjonsgenfylogenier støtter ikke et fjerde livsdomene for nukleocytoplasmatiske store DNA-virus . Researchgate.
8. ^ "Taxonomy Virus: 2019 Release" (html) . International Committee on Taksonomy of Viruses (ICTV ) . oktober 2018 . Hentet 13. oktober 2019 . 
9. ^ Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). LUCA og dets komplekse virus . Natur.