Åpen leseramme

I genetikk kalles RNA -sekvensen mellom et translasjonsstartkodon (AUG) og et termineringskodon en åpen leseramme ( ORF ) , med diskontering av sekvensene som tilsvarer introner , hvis noen. Den er avgrenset av UTR -ene (det vil si de uoversatte sekvensene). Navnet skyldes det faktum at når en av de tre mulige leserammene er etablert av startkodonet, er sekvensen "åpen" for transkripsjon , som fortsetter utover stoppkodonet.

Messenger -RNA inneholder minst én ORF; eukaryoter har vanligvis bare én, mens prokaryoter vanligvis har to eller flere; derfor kan de syntetisere forskjellige polypeptider . Messenger -RNA- er som inneholder mer enn én ORF er kjent som polycistroniske RNA - er, og de med bare én, monocistroniske .

I enhver DNA-sekvens er det, a priori , seks mulige retninger der åpne leserammer kan vises; siden hvert kodon tar tre nukleotider , er det tre mulige startsteder for å ta nukleotidene tre om gangen; hvis et fjerde nukleotid ble tatt som utgangspunkt, ville det samsvare med den åpne leserammen med den samme som om det første nukleotidet ble tatt, som man må legge til de tre andre mulige åpne leserammene, hvis DNA er oversatt med komplementær tråd som en form, og genererer dermed motsatt leseretning.

Disse åpne leserammene kalles +1, +2, +3, -1, -2 og -3.

I ett eksempel, med sekvensen 5' aactgcagtacgtaacgtca 3':

+2 5' aa ctg cag tac gta acg tca 3' +3 5' for å handle gca gta cgt aac gtc til 3' +1 5' aac tgc agt acg taa cgt ca 3' -1 3' ttg acg tca tgc att gca gt 5' -3 3' t tga cgt cat gca ttg cag t 5' -2 3' tt gac gtc atg cat tgc agt 5'

Hver av de seks mulige åpne leserammene vil gi opphav til en helt annen proteinsekvens.

Se også

Eksterne lenker