Juan Andrea Doria , (på italiensk Giovanni Andrea Doria , også kjent som Gianandrea Doria ) (1539–1606), var en admiral av den genovesiske flåten som deltok i slaget ved Lepanto.
Han var sønn av Giannettino Doria, og faren til kardinal Giovanni Doria . Han ble admiral for den genovesiske flåten i 1556 og sjef for den kombinerte kristne flåten til Den hellige liga i slaget ved Djerba i 1560, som ble vunnet av det osmanske riket under Piyale Pasha . Han deltok også i slaget ved Lepanto i 1571, og kommanderte høyre fløy; slaget ble vunnet av de kristne styrkene og var en svært bemerkelsesverdig begivenhet da det var første gang ottomanerne ble beseiret til sjøs. Doria ledet også en ekspedisjon mot Barbary-statene i 1601.
Han var kommandør av Santiago -ordenen , markis av Tursi og VI prins av Melfi (begge titlene arvet fra forholdet hans og hans adoptivfar, den berømte genovesiske admiralen Andrea Doria ).
Han giftet seg i 1558 med Zenobia del Carretto (1540-1590) og hadde: