Capsid



All kunnskapen som mennesket har samlet i århundrer om Capsid er nå tilgjengelig på internett, og vi har samlet og bestilt den for deg på en mest mulig tilgjengelig måte. Vi vil at du skal kunne få tilgang til alt relatert til Capsid som du vil vite raskt og effektivt; at opplevelsen din er hyggelig og at du føler at du virkelig har funnet informasjonen om Capsid som du lette etter.

For å nå våre mål har vi gjort en innsats for ikke bare å få den mest oppdaterte, forståelige og sannferdige informasjonen om Capsid, men vi har også passet på at utformingen, lesbarheten, lastehastigheten og brukervennligheten til siden være så hyggelig som mulig, slik at du på denne måten kan fokusere på det essensielle, kjenne til all data og informasjon som er tilgjengelig om Capsid, uten å måtte bekymre deg for noe annet, vi har allerede tatt hånd om det for deg. Vi håper vi har oppnådd vårt formål og at du har funnet informasjonen du ønsket om Capsid. Så vi ønsker deg velkommen og oppfordrer deg til å fortsette å nyte opplevelsen av å bruke scientiano.com.

Et kapsid er et proteinhylster av et virus , som omslutter dets genetiske materiale . Den består av flere oligomere (gjentagende) strukturelle underenheter laget av protein kalt protomerer . De observerbare tredimensjonale morfologiske underenhetene, som kanskje ikke stemmer overens med individuelle proteiner, kalles capsomerer . Proteinene som utgjør kapsidet kalles kapsidproteiner eller virale kappeproteiner (VCP). Kapsidet og det indre genomet kalles nukleokapsidet .

Capsids er stort sett klassifisert i henhold til strukturen. Flertallet av virusene har kapsider med enten spiralformet eller icosahedral struktur. Noen virus, for eksempel bakteriofager , har utviklet mer kompliserte strukturer på grunn av begrensninger i elastisitet og elektrostatikk. Den icosahedrale formen, som har 20 likesidet trekantede flater, tilnærmer seg en kule , mens den spiralformede formen ligner formen på en fjær , tar plassen til en sylinder, men er ikke en sylinder i seg selv. Kapsidflatene kan bestå av ett eller flere proteiner. For eksempel har munn- og klovsykevirus- kapsiden ansikter som består av tre proteiner kalt VP13.

Noen virus er innhyllet , noe som betyr at kapsidet er belagt med en lipidmembran kjent som viralhylsteret . Konvolutten hentes av kapsidet fra en intracellulær membran i virusets vert; eksempler inkluderer den indre kjernemembranen, Golgi -membranen og cellens ytre membran .

Når viruset har infisert en celle og begynner å replikere seg selv, blir nye kapsidunderenheter syntetisert ved hjelp av cellens proteinbiosyntesemekanisme . I noen virus, inkludert de med spiralformede kapsider og spesielt de med RNA-genomer, samles kapsidproteinene sammen med sine genomer. I andre virus, spesielt mer komplekse virus med dobbeltstrenget DNA-genom, samles kapsidproteinene til tomme forløper- procapsider som inkluderer en spesialisert portalstruktur ved ett toppunkt. Gjennom denne portalen blir viralt DNA translokert til kapsidet.

Strukturelle analyser av hovedkapsidprotein (MCP) -arkitekturer har blitt brukt til å kategorisere virus i avstamninger. For eksempel har bakteriofagen PRD1, algeviruset Paramecium bursaria Chlorella virus-1 (PBCV-1), mimivirus og pattedyr adenovirus blitt plassert i samme avstamning, mens hale, dobbeltstrengede DNA-bakteriofager ( Caudovirales ) og herpesvirus tilhører en andre slekt.

Spesifikke former

Icosahedral

Den icosahedral strukturen er ekstremt vanlig blant virus. Den ikosaeder består av 20 trekantformede flater avgrenset av 12 femdoblet toppunkter og består av 60 asymmetriske enheter. Dermed er et icosahedral -virus laget av 60N proteinunderenheter. Antall og arrangement av capsomerer i et icosahedral capsid kan klassifiseres ved hjelp av "kvasi-ekvivalensprinsippet" foreslått av Donald Caspar og Aaron Klug . I likhet med Goldberg -polyeder kan en icosahedral struktur betraktes som konstruert av pentamerer og heksamerer. Strukturene kan indekseres med to heltall h og k , med og ; strukturen kan tenkes som å ta h skritt fra kanten av en pentamer, snu 60 grader mot klokken og deretter ta k trinn for å komme til neste pentamer. Trianguleringstallet T for kapsidet er definert som:

I denne ordningen inneholder icosahedral kapsider 12 pentamerer pluss 10 ( T  - 1) heksamerer. Den T -Number er representative for størrelsen og kompleksiteten av kapsider. Geometriske eksempler for mange verdier av h , k og T finnes på Liste over geodesiske polyeder og Goldberg polyeder .

Mange unntak fra denne regelen eksisterer: For eksempel har polyomavirusene og papillomavirusene pentamerer i stedet for heksamerer i sekskvalente posisjoner på et kvasi-T = 7 gitter. Medlemmer av den dobbeltstrengede RNA- viruslinjen , inkludert reovirus , rotavirus og bakteriofag 6, har kapsider bygget av 120 kopier av kapsidprotein, tilsvarende et "T = 2" kapsid, eller uten tvil et T = 1 kapsid med en dimer i asymmetrisk enhet. På samme måte har mange små virus et pseudo-T = 3 (eller P = 3) kapsid, som er organisert i henhold til et T = 3 gitter, men med forskjellige polypeptider som inntar de tre kvasi-ekvivalente posisjonene

T-tall kan representeres på forskjellige måter, for eksempel kan T  = 1 bare representeres som en icosahedron eller en dodecahedron, og avhengig av typen kvasi-symmetri kan T  = 3 presenteres som en avkortet dodecahedron , en icosidodecahedron , eller en avkortet icosahedron og deres respektive dualer en triakis icosahedron , en rhombic triacontahedron , eller en pentakis dodecahedron .

Prolate

En langstrakt icosahedron er en vanlig form for hodet til bakteriofager. En slik struktur består av en sylinder med et lokk i hver ende. Sylinderen består av 10 langstrakte trekantede flater. Q -tallet (eller T midt ), som kan være et hvilket som helst positivt heltall, angir antall trekanter, sammensatt av asymmetriske underenheter, som utgjør de 10 trekanter i sylinderen. Hettene er klassifisert etter T (eller T ende ) nummer.

Bakterien E. coli er vert for bakteriofag T4 som har en prolatert hodestruktur. Det bakteriofagkodede gp31 -proteinet ser ut til å være funksjonelt homologt med E. coli chaparone -proteinet GroES og i stand til å erstatte det ved montering av bakteriofag T4 -virioner under infeksjon. Som groes, gp31 danner et stabilt kompleks med GroEL chaperonin som er absolutt nødvendig for folding og sammenstillingen in vivo av bakteriofag T4 viktigste kapsidprotein gp23.

Spiralformet

Mange stavformede og filamentøse plantevirus har kapsider med spiralformet symmetri . Den spiralformede strukturen kan beskrives som et sett med n 1 -D molekylære spiraler relatert til en n -fold aksial symmetri. Den spiralformede transformasjonen er klassifisert i to kategorier: endimensjonale og todimensjonale spiralsystemer. Å lage en hel spiralformet struktur er avhengig av et sett med translasjons- og rotasjonsmatriser som er kodet i proteindatabanken. Helisk symmetri er gitt med formelen P  =   x  , hvor er antallet strukturelle enheter per sving av helixen, er den aksiale stigningen per enhet og P er helixens tonehøyde. Det sies at strukturen er åpen på grunn av egenskapen til at et hvilket som helst volum kan omsluttes ved å variere lengden på spiralen. Det mest forståtte spiralformede viruset er tobakkmosaikkviruset. Viruset er et enkelt molekyl av (+) streng RNA. Hvert strøkprotein på det indre av spiralen binder tre nukleotider i RNA -genomet. Influensa A -virus er forskjellige ved å omfatte flere ribonukleoproteiner, det virale NP -proteinet organiserer RNA i en spiralformet struktur. Størrelsen er også forskjellig; tobakkmosaikkviruset har en 16,33 proteinunderenheter per spiralformet sving, mens influensa A -viruset har en 28 aminosyre halesløyfe.

Funksjoner

Kapsidets funksjoner er å:

  • beskytte genomet,
  • levere genomet, og
  • samhandle med verten.

Viruset må sette sammen et stabilt, beskyttende proteinskall for å beskytte genomet mot dødelige kjemiske og fysiske midler. Disse inkluderer former for naturlig stråling , ekstremer av pH eller temperatur og proteolytiske og nukleolytiske enzymer . For ikke-innhyllede virus kan selve kapsidet være involvert i interaksjon med reseptorer på vertscellen, noe som fører til penetrasjon av vertscellemembranen og internalisering av kapsidet. Levering av genomet skjer ved påfølgende avdekking eller demontering av kapsidet og frigjøring av genomet til cytoplasma, eller ved utstøting av genomet gjennom en spesialisert portalstruktur direkte inn i vertscellekjernen.

Opprinnelse og evolusjon

Det har blitt antydet at mange virale kapsidproteiner har utviklet seg ved flere anledninger fra funksjonelt forskjellige cellulære proteiner. Rekrutteringen av cellulære proteiner ser ut til å ha skjedd på forskjellige evolusjonstrinn, slik at noen cellulære proteiner ble fanget opp og funksjonalisert før divergensen av cellulære organismer til de tre samtidige livsområdene, mens andre ble kapret relativt nylig. Som et resultat er noen kapsidproteiner utbredt i virus som infiserer fjernt beslektede organismer (f.eks. Kapsidproteiner med gelévalsen ), mens andre er begrenset til en bestemt gruppe virus (f.eks. Kapsidproteiner fra alfavirus).

En beregningsmodell (2015) har vist at kapsider kan ha oppstått før virus og at de tjente som et middel for horisontal overføring mellom replikatorsamfunn siden disse samfunnene ikke kunne overleve hvis antallet genparasitter økte, med visse gener som var ansvarlige for dannelsen av disse strukturene og de som favoriserte overlevelse av selvreplikerende samfunn. Flytting av disse forfedre genene mellom celleorganismer kan favorisere utseendet av nye virus under evolusjonen.

Se også

Referanser

Videre lesning

Eksterne linker

Opiniones de nuestros usuarios

Willy Nygaard

Oppføringen på Capsid har vært veldig nyttig for meg.

Berit Pedersen

Takk. Artikkelen om Capsid hjalp meg.

Arvid Nygaard

Det stemmer. Gir nødvendig informasjon om Capsid.

Espen Haugland

Noen ganger når du leter etter informasjon på internett om noe, finner du for lange artikler som insisterer på å snakke om ting som ikke interesserer deg. Jeg likte denne artikkelen om Capsid fordi den går til poenget og snakker om akkurat det jeg vil, uten at gå seg vill i informasjon ubrukelig.

Susanne Brekke

Takk for dette innlegget om Capsid, det er akkurat det jeg trengte.