Caral -Supe Special Archaeological Project , ble opprettet av den peruanske staten i februar 2003, knyttet til det daværende National Institute of Culture , på grunnlag av Caral-Supe Archaeological Project, opprettet og regissert av arkeologen Ruth Shady siden 1996.
Siden 2010 er det Caral Archaeological Zone, utførende enhet 003 i Kulturdepartementet. Det er dedikert til forbedring (forskning, bevaring, turistinnkvartering, formidling og administrasjon) av ti monumentale arkeologiske steder i Supe-dalen (Sacred City of Caral, Chupacigarro, Áspero, Miraya, Lurihuasi, Allpacoto, Era de Pando, Pueblo Nuevo, Piedra Parada og El Molino) og et monumentalt arkeologisk sted i Huaura-dalen (Vichama).
På samme måte utvikler den en offentlig arkeologi dedikert til å fremme den sosiale og økonomiske utviklingen av den omkringliggende befolkningen, lokal og regional, basert på revaluering av den arkeologiske arven og dens bruk for turisme, forbedring av sosiale relasjoner, opplæring av befolkningen for bærekraftig produksjon, fremme av produktive infrastrukturprosjekter, og etablering av tilstrekkelige utdannings- og helseforhold. Disse oppgavene er innrammet i "Master Plan for Supe Valley og dens innflytelsesområde", overlatt til Caral Archaeological Zone ved lov fra republikkens kongress, siden mars 2006.
Arkeolog Ruth Shady har vært leder for institusjonen siden 2003.